Estudo de técnicas de modelagem molecular comparativa por homologia e Dinâmica Molecular para sistemas Protéicos e Peptídicos

Resumo: Embora o número de estruturas resolvidas por métodos experimentais venha crescendo aceleradamente nos últimos anos, devido aos avanços alcançados em técnicas de determinação estrutural, ainda existe comparativamente pouca informação estrutural disponível para a maioria das proteínas comparadas ao número de seqüências primárias depositadas em bancos de dados de seqüências. Dessa forma, há uma constante necessidade de elaboração de modelos estruturais virtuais de proteínas para ajudar no processo de identificação e otimização de protótipos de medicamentos e alvos moleculares. Em relação a esse quesito, a estratégia da modelagem molecular por homologia estrutural oferece uma alternativa satisfatória para solução deste problema. A técnica baseia-se no conhecimento de que a conformação estrutural de uma proteína é mais conservada que sua seqüência de aminoácidos, durante o processo evolutivo. Assim, proteínas homólogas com estruturas resolvidas podem ser utilizadas como molde na construção de modelos de proteínas-alvo, em que o grau de confiabilidade do processo é altamente dependente do grau de similaridade entre as seqüências.

Data de início: 01/06/2011
Prazo (meses): 24

Participantes:

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Coordenador ALEXANDRE MARTINS COSTA SANTOS
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